Nat Cancer | 吴婧怡等发现胶质瘤恶化的关键转变
异柠檬酸脱氢酶 （ IDH ） 突变型胶质瘤，是30-40岁人群中最常见的脑肿瘤。IDH突变会产生致癌代谢物，抑制DNA去甲基化酶活性，导致表观遗传变化。虽然大多数这类肿瘤在确诊时，为低级别肿瘤，并缓慢生长多年。但其最终会转化为，侵袭性强的，高级别肿瘤，导致脑功能丧失并致命。2024年8月，FDA批准了近20年来的首款胶质瘤治疗药物-- IDH抑制剂 （vorasidenib） 。但临床上发现，只有早期病人对该药物有响应。那么，在肿瘤从早期向晚期转化的过程中，发生了什么？这些变化如何增加了肿瘤的侵袭性和抗药性呢？
为了回答这些问题，2024年11月21日，Dana-Farber癌症研究所的 Bradley Bernstein 团队 （吴婧怡和Nicolas Gonzalez Castro为共同第一作者） 在 Nature Cancer 上发表了文章 Evolving cell states and oncogenic drivers during the progression of IDH-mutant gliomas ， 报道了IDH突变型胶质瘤，从早期到晚期的过程中，细胞类型和癌症驱动因子的变化。
为了研究细胞类型的变化，研究者收集了早晚期患者的肿瘤样本，利用单细胞技术，分析了肿瘤细胞的基因表达和染色质特征。比较癌细胞与正常脑细胞后发现，早期肿瘤的细胞，类似少突胶质祖细胞 （OPCs） 。而晚期肿瘤细胞，更像神经祖细胞 （NPCs） 。胚胎发育期，正常的NPCs能快速增殖，支持大脑发育。但在成年后却逐渐消失。而由NPCs分化而成的OPCs，成为成人大脑主要的可增殖细胞之一。肿瘤的进展，类似一个从OPCs到NPCs的逆分化的过程。这说明癌细胞的起源类型 （OPCs） 和晚期类型 （NPCs） 具有差别，这为提早识别有恶化倾向的肿瘤 （富集NPC的肿瘤） ，选择不同的治疗方案，提供了参考。
为了研究癌症驱动因子的变化，研究者比较了早晚期患者的，遗传和表观遗传的特征。结果发现，早期癌细胞DNA甲基化水平较高，由IDH突变引起。高水平的甲基化，可以维持癌基因高表达、抑制抑癌基因和干扰素通路，这是早期肿瘤发生，并逃避免疫系统监测的关键原因。随着肿瘤进展，DNA甲基化逐渐降低，基因组中出现更多遗传变异，如癌基因扩增、抑癌基因和干扰素通路基因的缺失。这也解释了FDA新批准的IDH药物，为何仅对早期胶质瘤有效，对晚期的IDH胶质瘤无效。因为肿瘤进展过程中，早期依赖表观遗传变异 （IDH 变异和DNA高甲基化） 驱动增殖；晚期则依赖遗传变异 （基因的扩增和缺失） 驱动增殖。
该研究揭示了肿瘤进展过程中，细胞类型和癌症驱动因子的动态变化。指出了靶向IDH胶质瘤，在早期和晚期，需要采取不同的策略。第一作者吴婧怡，目前在哈佛医学院的Beth Israel Deaconess医疗中心，成立了独立实验室，欢迎对表观遗传学和基因组学感兴趣的研究者加入。
https://www.nature.com/articles/s43018-024-00865-3
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