用益生菌帮助抗癌!《自然》:全新细菌疫苗一箭双雕,清除肿瘤还能防止复发

人体的肠道内栖息着海量的肠道菌,许多益生菌可以帮助维护肠道黏膜,提供人体所需的代谢分子,甚至抵御外来的有害菌群。尽管名字叫肠道菌,但近些年的研究正不断揭示出它们的“自由”特征,比如一些细菌可能会离开肠道抵达肝脏、淋巴结等区域,并重新定植和存活下来。还有一些细菌出现在了肿瘤内部,此处缺氧的微环境深受某些厌氧菌的喜爱。

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已有的研究显示, 肿瘤中的细菌可以一定程度上抑制癌细胞生长 ,因为它们可以刺激免疫反应的产生,但这种刺激往往不够持久或引导击杀肿瘤的效率不高。来自哥伦比亚大学的Nicholas Arpaia教授从这些现象中获得了一些灵感:既然天然状态下,细菌的免疫刺激不具备特异性,那么 人为改造细菌让它们表达肿瘤的抗原蛋白,是否就能够获得一种全新的抗肿瘤策略呢?

在最新的《自然》杂志上,他和同事们共同将这一想法付诸实践,以益生菌Nissle 1917(一种非致病性的大肠杆菌)为基础设计了肿瘤特异性的细菌疫苗,这些改造过的细菌能够表达肿瘤独特的抗原,引发高度靶向性的免疫刺激, 既能帮助控制原位肿瘤体积,也能阻止循环系统中的癌细胞进行转移,有望成为一举两得的癌症治疗方式

对于肿瘤治疗来说, 新生抗原(Neoantigens) 是一个极具前景的研究方向,这些抗原拥有独特的氨基酸序列。健康的细胞并不会拥有新生抗原,所以靶向此类分子可以避免对健康细胞造成损伤。此外,不同患者与肿瘤之间的新生抗原也具有差异,需要根据个体情况来设计对应的靶向疗法。因此,想要广泛使用这一策略,就需要高效的新生抗原设计和生产平台。

恰好,细菌能够承担这一任务。 细菌已经成为 一种广泛使用的蛋白生产工具,人类可以通过改造细菌的基因让其表达自己所需的蛋白质,新生抗原也不例外。

在实验中,作者测试的是CT26小鼠结直肠癌细胞系,他们对其进行了外显子与转录组测序。根据测序结果与现有数据库的比对,研究从中确认了CT26特异性的突变序列,并从中筛选出了最合适的新生抗原序列。

▲改造大肠杆菌可以有望带来癌症细菌疫苗的治疗策略 (图片来源:参考资料[1])

除了将新生抗原序列插入Nissle 1917的基因中,作者还额外进行了一些设计,比如去除细菌的两种蛋白酶来增加新生抗原累积,另外抑制细菌产生免疫逃逸的机制,让细菌在完成任务后或找不到肿瘤时逐渐被免疫系统清除。

随后,作者尝试将CT26肿瘤移植到了小鼠皮下,一段时间后他们分别向肿瘤内部注射了野生型的Nissle 1917菌株,以及能产生新生抗原的改造菌株。结果显示,野生型菌株没有展现出控制肿瘤生长的效果, 但改造菌株逐渐发挥出了强大的抗肿瘤效应,与对照组相比,小鼠的肿瘤体积缩小,生存期得到显著延长 。除此之外,肿瘤内部有着更高水平的白介素-12p70,该分子能够刺激辅助T细胞1,提升免疫系统清除肿瘤的效率。


▲定植在肿瘤内部的益生菌可以刺激抗肿瘤的免疫反应 (图片来源:参考资料[2],credit:Columbia University)

另外, 静脉注射细菌疫苗也可以发挥肿瘤抑制效果 ,作者能在肿瘤内部检测到定植的Nissle 1917改造菌株,而循环系统中的细菌则会逐渐被清除,不会产生细菌感染的情况。如果提前注射细菌疫苗,再进行肿瘤移植,这一方式也能阻止肿瘤发展。根据他们的长期观察,细菌疫苗可以预防同类型肿瘤的再次生长,因此 还能发挥防止癌症复发的作用

作者指出,确认这样一套完整流程的可行性之后,他们希望未来在人类中提供个性化的诊疗手段。研究者只需获取患者的肿瘤样本,然后通过基因测序找到特异性的新生抗原,就可以构建出治疗性的细菌疫苗输回体内,发挥抗肿瘤效果。

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