《细胞》重磅：数千抗癌靶点一网打尽！有望推动抗癌疗法新飞跃
随着测序技术的发展，科学家可以对众多不同类型的细胞进行转录组、蛋白质组层面的分析，其中也包括癌细胞。当下，各种针对癌症的靶向疗法研究正不断获得新的突破，这类疗法要比放疗、化疗更加精准，治疗的毒副作用也更少。包括抗体偶联药物、单克隆抗体、癌症疫苗、免疫检查点抑制剂在内的靶向疗法，它们基本针对的靶点大多是蛋白质，因此获取更广泛的基因与蛋白质的信息就显得格外重要。
目前，临床蛋白质组肿瘤分析联盟（CPTAC）就已经对超过1000多个未经治疗的原位肿瘤样本进行了基因组与蛋白质组表征分析，该分析囊括了10种癌症细胞类型，也因此提供了大量的泛-癌症蛋白质基因组信息。
在近期发表于《细胞》的研究中，贝勒医学院 章冰 团队、复旦大学 高强 团队及中国科学院分子细胞科学卓越创新中心 高大明 团队共同合作，对CPTAC的数据与现有的其他公共数据库进行了整合分析， 研究为肿瘤治疗靶点提供了革命性的信息全景图，同时也给癌症诊断，药物再利用以及新药物研发带来了全新见解 。
新研究分析的主要数据来自CPTAC中1000多个肿瘤样本以及524个正常组织，包括结肠腺癌、肺鳞状细胞癌、胰腺导管腺癌、肺腺癌等10种类型。研究通过分析基因突变、基因拷贝数变异、甲基化以及转录本、蛋白质磷酸化位点丰度，对潜在的成药靶点进行了筛选和评估，用以预测哪些药物靶点会更有效，研究总共展示了2863个成药靶点信息。
这些潜在治疗靶点信息已经总结并公布在了网站 https://targets.linkedomics.org ，可以随时进行检索、查阅。这些靶点被分成了5个层级，研究同时对各靶点进行了评分：
1级：被任何管理机构批准用于任何癌症类型的药物所针对的靶点，这类靶点中超过30%为激酶。
2级：被批准用于治疗癌症之外的药物所针对的靶点，这类靶点中以离子通道、G蛋白偶联受体居多。
3级：处于调查、试验阶段药物所针对的靶点，其中大比例为表观遗传类药物。
学术经纬为大家整理了不同级别中部分评分居前的靶点：
在文章总结中，作者额外提到了KRAS蛋白。他们发现大多数预测的新抗原都是对单个患者特异性的，但有5个KRAS的突变肽被预测在44名患者中产生了新抗原，同时涉及到了4种癌症类型，这也说明它们有可能成为潜在的公共新抗原。这些信息无疑将会为肿瘤治疗靶点研究铺平道路，加速各类全新的癌症疗法研发进程，让更多癌症患者受益。
[1] Pan-cancer proteogenomics expands the landscape of therapeutic targets. Cell (2024). DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.05.039
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